Lilo, Stitch, Jumba ve Pleakley sonunda Jumba’nın genetik deneylerini bulurlar ve hepsini ayrı ayrı ait oldukları yerlere götürürler. Stitch, Jumba ve Pleakley’e Galaktik İttifak’ta önemli mevkiler teklif edilir fakat hepsi Lilo ile dünyada kalabilmek için bu teklifleri geri çevirirler. Fakat Lilo, uzaylı arkadaşlarının ait oldukları yerin dünya olmadığını anlamıştır ve sonunda "aloha" demek zamanı gelmiştir. Bu arada Gantu, dünyadan ayrılıp doktor Jacques Von Hamsterviel’i hapishaneden kaçırmıştır. Doktor ise Leroy adında bir deney yaratıp onu klonlamayı ve onun sayesinde bütün galaksiyi ele geçirmeyi planlamaktadır.